晋元帝渡江之初，寄居丹阳郡江乘县境（今江苏句容市北），后割吴郡海虞县北境（今江苏常熟市），作为东海郡辖下郯、朐、利城、祝其、厚丘、西隰、襄贲7个侨县的实土。晋穆帝永和年间，移东海侨郡及郯、朐、利城3个侨县出居京口（今江苏镇江市）。刘宋元嘉八年（431年）立南徐州，东海侨郡作为其州治郡。为与徐州东海郡作区别，称“南东海郡”，又割晋陵郡丹徒、武进、毗陵3县隶属其郡。[1]南齐移治涟水（今江苏涟水县），下领郯、祝其、襄贲、利城、西隰、丹徒、武进7县。[2]
南梁天监元年（502年），改南东海郡为南兰陵郡。[3]南陈永定二年（558年）复为南东海郡。[4]隋朝开皇九年（589年），隋灭南陈，废郡入润州。
注释
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江州#
湘州#
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注释
彭城郡（内史420-445） | 沛郡 | 下邳郡 | 东海郡（内史445-468） | 东莞郡 | 琅邪郡 | 兰陵郡 | 东安郡 | 宿预郡 | 淮阳郡（内史448-452） | 济阴郡 | 北济阴郡
历阳郡（内史460-461） | 南谯郡（内史432-453） | 庐江郡（内史468-469） | 马头郡 | 晋熙郡（内史467-479） | 弋阳郡 | 宣城郡 | 义阳郡（内史445-467） | 南汝阴郡 | 淮南郡（内史463-466）
江夏郡（内史424-479） | 安陆郡（内史458-465，相478） | 竟陵郡（内史424-432、453-459，相477-479） | 隋阳郡（隋郡420-478）（内史449-453、478-479） | 武陵郡（内史435-453、470-479） | 天门郡 | 巴陵郡（内史456-479） | 武昌郡（内史452-455） | 西阳郡（内史456-461）
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寻阳郡（相479-498） | 豫章郡（内史479-502） | 临川郡（内史479-502） | 庐陵郡（内史482-502） | 鄱阳郡（内史479-494、501-502，相494-500） | 安成郡（内史479-502） | 南康郡（相479-490，内史490-500） | 南新蔡郡 | 建安郡（内史482-501，相501-502） | 晋安郡（内史482-502）
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南郡（内史479-493、497-498） | 南平郡（内史483-495） | 天门郡 | 宜都郡（内史483-494） | 汶阳郡 | 武宁郡 | 巴东郡（内史488-490，相490-502） | 建平郡 | 河东郡（内史486-498）
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南义阳郡 | 北义阳郡 | 隋郡（内史482-499） | 齐安郡 | 淮南郡 | 宋安左郡 | 安蛮左郡 | 永宁左郡 | 东义阳左郡 | 东新安左郡 | 新城左郡 | 围山左郡 | 北淮安左郡 | 南淮安左郡 | 北随安左郡 | 东随安左郡
襄阳郡（相479-483） | 南阳郡 | 新野郡 | 始平郡 | 广平郡 | 京兆郡 | 扶风郡 | 冯翊郡 | 河南郡 | 华山郡 | 顺阳郡 | 齐安郡 | 齐康郡 | 招义郡 | 西汝南北义阳二郡
西新安郡 | 义宁郡 | 南襄郡 | 北建武郡 | 蔡阳郡 | 永安郡 | 安定郡 | 怀化郡 | 武宁郡 | 新阳郡 | 义安郡 | 高安左郡 | 义阳郡 | 南襄城郡 | 广昌郡 | 东襄城郡 | 北襄城郡 | 怀安郡 | 弘农郡 | 西弘农郡 | 析阳郡 | 汉广郡 | 中襄城郡
长沙郡（内史479-502） | 衡阳郡（内史479-494、495-502，相494-495） | 桂阳郡（内史479-502） | 零陵郡（内史479-502） | 永阳郡（营阳郡）（内史?-498） | 湘东郡（内史490-502） | 邵陵郡（内史486-502） | 始兴郡（广兴郡）（内史479-502） | 临贺郡（内史489-498） | 始安郡（内史479-502）
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汝阴郡（内史502-557） | 弋阳郡 | 财丘郡 | 梁兴郡 | 西恒农郡 | 陈南郡 | 清河郡 | 南阳郡 | 汝南郡 | 太原郡 | 东恒农郡 | 新蔡南陈留二郡 | 荥阳郡 | 北通郡 | 新兴郡 | 东郡
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河南地区
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蜀中南中地区
江表地区
沅湘地区
巴陵郡（内史557-589）
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宜都郡（内史573-589）
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岭南地区
位置不详
注释