- 外交部 部长：王毅
- 国防部 部长：常万全（兼）
- 国家发展和改革委员会 主任：徐绍史 → 何立峰
- 教育部 部长：袁贵仁 → 陈宝生
- 科学技术部 部长：万钢（致公党，全国政协副主席）
- 工业和信息化部 部长：苗圩
- 国家民族事务委员会 主任：王正伟（回族，全国政协副主席） → 巴特尔（蒙古族）
- 公安部 部长：郭声琨（兼） → 赵克志
- 国家安全部 部长：耿惠昌 → 陈文清
- 监察部 部长：黄树贤 → 杨晓渡
- 民政部 部长：李立国 → 黄树贤
- 司法部 部长：吴爱英（女） → 张军
- 财政部 部长：楼继伟 → 肖捷
- 人力资源和社会保障部 部长：尹蔚民
- 国土资源部 部长：姜大明
- 环境保护部 部长：周生贤 → 陈吉宁 → 李干杰
- 住房和城乡建设部 部长：姜伟新 → 陈政高 → 王蒙徽
- 交通运输部 部长：杨传堂 → 李小鹏
- 水利部 部长：陈雷
- 农业部 部长：韩长赋
- 商务部 部长：高虎城 → 钟山
- 文化部 部长：蔡武 → 雒树刚
- 国家卫生和计划生育委员会 主任：李斌（女）
- 中国人民银行 行长：周小川（全国政协副主席）
- 审计署 审计长：刘家义→胡泽君（女）
1 直属特设机构
16 直属机构
4 办事机构
13 直属事业单位
13 部委管理的
16 国家局
16 国家局
37 议事协调机构
（括注承担具体工作
的机构）
（括注承担具体工作
的机构）
- 国防动员（发改委、军委联参、军委政工、军委后勤）
- 边海防（军委联参）
- 空中交通管制（军委联参）
- 爱国卫生运动（卫生计生委）
- 绿化（林业局）
- 学位（教育部）
- 防汛抗旱（水利部）
- 妇女儿童（全国妇联）
- 双拥（民政部、军委政工）
- 残疾人（中国残联）
- 扶贫开发（单设办公室）
- 关税税则（财政部）
- 减灾（民政部）
- 科技教育（国办）
- 军转安置（人社部）
- 禁毒（公安部）
- 老龄（民政部）
- 西部开发（发改委）
- 振兴老工业基地（发改委）
- 汶川地震（发改委）
- 信息化（工信部）
- 节能减排（发改委）
- 能源（能源局）
- 安全生产（安监总局）
- 艾滋病（卫生计生委）
- 反垄断（商务部）
- 森林防火（林业局）
- 三峡工程（单设办公室）
- 南水北调工程（单设办公室）
- 纠风（监察部）
- 医改（发改委）
- 中小企业（工信部）
- 食品安全（食药监总局）
- 农民工（人社部）
- 一带一路（发改委）
- 制造强国建设（工信部）
批准后未实际组建：海洋（海洋局）
撤销后保留办事机构：安置印支难民（民政部）