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行政機關，又稱行政機構、行政部門，其工作是對組織進行日常的管理並施行法律政策等相關活動。廣義上，行政定義為負責國家政策的執行的政府機構。狹義上，則專指內閣等行政決策機構，而只從事事務性執行工作的人員和機構則歸為官僚機構[1]。但是這種區分也存在爭議，例如法國大革命前以及歐洲的許多君主立憲政體，佔據行政機構頂端的部長職位的也是行政管理者[2]。
在基於所謂「三權分立」原則的政治制度中，權力分佈在行政、立法、司法之間。在這樣的系統中，行政部門不通過法律（立法機構的作用）或解釋它們（司法機構的作用）。相反，行政部門執行立法機關製定並由司法機關解釋的法律。行政可以是某些類型的法律的來源，例如法令或行政命令。行政官僚機構通常是法規的來源。
在使用類似議會制的政治制度中，行政機構通常被稱為政府，而立法機關通常被稱為「議會」或簡稱為「立法機關」，行政機構通常是立法機構的一部分，或需要立法機關的信任供給（需要立法機關的支持、批准）。在議會主權中，行政機關的權力和組織完全取決於立法機關授予它的權力，行政機關的行為可能會或可能不會受到司法審查，而司法審查也受到立法機關的控制。在立法機關是主權的系統中，行政部門也可能擁有立法或司法權力。
結構
任何國家的行政結構都呈金字塔型，層級關係嚴格，上級領導下級，下級必須嚴格執行上級的命令。這種結構有效率，理性，但是也會因為機構龐雜而造成機械僵化的問題[1]。
一個國家的行政機構大體上可以分為[1]：
- 領導機構：即各行政部門的首腦和核心，主要職責是對轄下的重大行政問題進行決策，並指揮與監督決策的實施，也對轄下的工作進行協調。
- 辦公機構：領導機構的輔助辦事機構，主要職責包括日常辦公室事務，協調工作，輔助決策以及領導機構臨時交辦的工作或特別事務，例如各種辦公室
- 諮詢機構：也就是智囊團或參謀機構，通過調查研究、政策協調等方式，對領導機構的決策進行輔助。
- 信息機構：負責信息情報的收集整理，為領導機構提供信息服務，常見的部門有統計局、情報部門、檔案室、資料室等
- 職能機構：在領導機構領導下，負責組織一個或多個專門的行政事務，例如一個部下的各個局。
- 派出機構：是某一級政府根據轄區授權委託，代表政府的分支機構。例如中國的行政公署、區公所、街道辦事處。主要職責包括監督檢查下級行政機構執行上級行政機構的命令、決策，並向委派機構報告轄區內的情況等。
- 監督機構：各種行政監察機構，審計機構，負責對各行政機構及其人員進行執法性監督和檢查。
- 國家元首——通常是君主、總統或最高領袖、主要的公共代表和民族團結的活生生的象徵。
- 政府首腦——通常是總理，監督所有國家事務的管理者。
職能
行政機構的功能就是執行國家意志。包括憲法和法律的執行，並參與國家立法；對國家內外政策進行決策和實施，任免政府官員；管理國家公共事務；向立法機構提出預算，干預和調整社會經濟[1]。
一般而言，政府行政部門和普通公民的接觸和掌握的資源都最多、對公民的生活影響也最大，因此憲政和分權的主要目的就是要限制和制衡行政部門的權力。但是在實際層面上，行政機構往往具有一定的自由裁量權，而不僅僅是執行。取決於政治制度的不同，有些國家的行政機構擁有難以監控的強大權力，甚至在一些國家，行政機構幾乎就是國家的決策中心。在不少國家，行政機構已經成為了事實上的主要立法者。許多議案都是由行政機構起草，然後交由議會通過。在經濟社會領域，行政機構可以單獨發佈和正式立法相同作用的各種規則，以影響公民的社會生活[1]。
雖然行政機構的權力在不斷擴大，但是對其制約的機制也在不斷完善。立法機構通過專業化和委員會方式，司法機構通過監督方式都在規制行政機構的權力[1]。技術的進步，互聯網的發展在使公民能夠更多的影響社會的同時，也在制約着行政力量[2]。