上海市兒童醫院與上海交通大學附屬兒童醫院一個機構兩塊牌子，共有2個院區。北京路院區位於中國上海市北京西路1400弄24號，瀘定路院區位於中國上海市瀘定路355號，另外上海市兒童醫院在上海市梅川路建有兒童康復中心。上海市兒童醫院是一所三級甲等的兒童醫院[1]。
醫院現有員工1500餘人。北京路院區該院占地1.59公頃，建築面積約為2.5萬平方千米，有床位150張。瀘定路院區占地面積約2.6公頃，核定床位550張。[1]
該院前身是1937年由富文壽、蘇祖斐等人創辦的上海難童醫院，1953年改為上海市兒童醫院，2003年成為上海交通大學附屬兒童醫院[1]。
