异构酶(英语:isomerase)是一种催化同分异构体转换的酶。异构酶因而催化以下的反应:
异构酶是以“(底物)异构酶”这种格式来命名,如脂酰辅酶A脱氢酶。或是以“(底物)(异构酶种类)”来命名,如磷酸葡萄糖变位酶。
异构酶在EC编号中分类为EC5,并再细分为6个子类: