病毒分类表

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本页面列出了病毒的分类,包含病毒以及类病毒朊毒体卫星病毒亚病毒因子

生物分类表

由于病毒并不像其他生物能借由交配产生后代,因此在种别的定义上与一般生物有所不同。

概论

ICTV 分类法

国际病毒分类委员会(英文:International Committee on Taxonomy of Viruses,简称 ICTV)是国际微生物学联合会(英文:International Union of microgical Societies)发展、改进和维护通用病毒分类的唯一机构,在1966年建立起了一个病毒分类的通用系统和统一的命名法则。第七届 ICTV 会议首次规范化了病毒物种的概念,即病毒分类的分支层次中的最低分类单元[1]。分类的主要依据是病毒颗粒的特性、抗原特性与生物特性。

到目前为止只有一小部分的病毒得到了研究,从来自人体的病毒样品中发现有20%的序列是未曾发现过的,而来自环境中(如海水、大洋沉积物等)的病毒样品则大部分的序列都是全新的[2]

病毒分类从域开始,结构如下,分类后缀在括号中:[3]

Realm(-viria
亚域 Subrealm(-vira
Kingdom(-viriae
亚界 Subkingdom(-virites
Phylum(-viricota
亚门 Subphylum(-viricotina
Class(-viricetes
亚纲 Subclass(-viricetidae
Order(-virales
亚目 Suborder(-virineae
Family(-viridae
亚科 Subfamily(-virinae
Genus(-virus
亚属 Subgenus(-virus
Species

物种名称通常以“疾病”病毒的形式出现,尤其是感染高等动植物的类群。 ICTV 2022版分类表中总共有6个域、10个界、17个门、2个亚门、40个纲、72个目、8个亚目、264个科、182个亚科、2818个属、84个亚属与11273个种。除亚域、亚界和亚纲外,其他级别的分类单元都被使用。共有6个域、1个地位未定纲、19个地位未定科及2个地位未定属被承认[4]

巴尔的摩分类法

巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的合成方式

诺贝尔奖获得者生物学家戴维·巴尔的摩在1970年代提出了巴尔的摩分类系统[5]。巴尔的摩分类法与ICTV分类法一起用于现代病毒的分类[6][7][8]

巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中,必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制,但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的 RNADNA,可以有也可以没有反转录酶。而且,单链RNA病毒可以是正义(+)或反义(-)。这一分类法将病毒分为7类:

举一个病毒分类的例子:水痘病毒,即带状疱疹病毒,属于疱疹病毒目疱疹病毒科甲型疱疹病毒亚科水疱病毒属;同时,带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类,因为它是双链 DNA 病毒,且不含有反转录酶。

ICTV 2022版病毒分类表

此套分类系统与细胞生物分类系统有许多共同特征,如分类单元结构,但也存在一些差异,比如所有分类名称都使用斜体,这与国际藻类、真菌和植物命名法国际动物命名法不同。

A型DNA病毒域 Adnaviria

双链DNA病毒域 Duplodnaviria

  • 香港病毒界 Heunggongvirae 2门
    • 衣壳病毒门 Peploviricota 1纲
    • 尾噬菌体门 Uroviricota 1纲
      • 有尾噬菌体纲 Caudoviricetes 7目
        • 有尾噬菌体目 Caudovirales 4科
          • Crevaviridae 2亚科
          • Intestiviridae 3亚科
          • Steigviridae 1亚科
          • Suoliviridae 5亚科
        • Juravirales 2科
          • Yangangviridae 3属
          • Yanlukaviridae 1属
        • Kirjokansivirales 4科
          • Graaviviridae 2属
          • Haloferuviridae 3属
          • Pyrstoviridae 1属
          • Shortaselviridae 1属
        • Magrovirales 1科
          • Aoguangviridae 1属
        • Methanobavirales 2科
          • Anaerodiviridae 1属
          • Leisingerviridae 1属
        • Nakonvirales 2科
          • Ahpuchviridae 1属
          • Ekchuahviridae 1属
        • Thumleimavirales 4科
          • Druskaviridae 2属
          • Hafunaviridae 4属
          • Halomagnusviridae 1属
          • Soleiviridae 1属
        • 地位未定科
          • 埃凯曼病毒科 Ackermannviridae 2亚科、7属
          • Aggregaviridae 1属
          • Aliceevansviridae 3属
          • Arenbergviridae 1属
          • Assiduviridae 3属
          • 自复制短尾噬菌体科 Autographiviridae 9亚科、71属
          • Casjensviridae 24属
          • 蔡斯噬菌体科 Chaseviridae 2亚科、1属
          • 德默莱兹噬菌体科 Demerecviridae 3亚科、5属
          • 德雷克斯勒噬菌体科 Drexlerviridae 4亚科、8属
          • Duneviridae 3属
          • Fervensviridae 1属
          • Forsetiviridae 1属
          • Fredfastierviridae 1属
          • Grimontviridae 5属
          • 格兰噬菌体科 Guelinviridae 1亚科、3属
          • Helgolandviridae 1属
          • 代列尔噬菌体科 Herelleviridae 5亚科、8属
          • Kleczkowskaviridae 1属
          • Kyanoviridae 54属
          • Madisaviridae 1属
          • Mesyanzhinovviridae 2亚科、1属
          • Molycolviridae 1属
          • Naomviridae 1属
          • Orlajensenviridae 1亚科
          • Pachyviridae 3属
          • Peduoviridae 58属
          • Pervagoviridae 1属
          • Pootjesviridae 1亚科、4属
          • Pungoviridae 1属
          • 朗特里噬菌体科 Rountreeviridae 2亚科、2属
          • 萨拉玛噬菌体科 Salasmaviridae 3亚科、5属
          • Saparoviridae 2属
          • 斯基托噬菌体科 Schitoviridae 9亚科、27属
          • Speroviridae 1属
          • Stanwilliamsviridae 2亚科
          • Straboviridae 3亚科、15属
          • Suolaviridae 1属
          • Verdandiviridae 2属
          • Vertoviridae 2属
          • Vilmaviridae 2亚科、2属
          • Winoviridae 2属
          • Zierdtviridae 2亚科
          • 佐贝尔噬菌体科 Zobellviridae 1亚科、6属
          • 地位未定亚科、属

单链DNA病毒域 Monodnaviria

包含4界

RNA病毒域 Riboviria

包含2界、2科、4属

核酶病毒域 Ribozyviria

多变DNA病毒域 Varidnaviria

包含2界

地位未定种类

地位未定纲:

地位未定科:

地位未定属:

亚病毒因子(Subviral Agents)

卫星(Satellites)

  • 卫星病毒 Satellite virus
    • 单链RNA卫星病毒 Single-stranded RNA satellite virus
    • 双链DNA卫星病毒 Double-stranded DNA satellite virus
    • 未定属
  • Satellite nucleic acid
    • Single-stranded satellite DNA
    • Double-stranded satellite RNA
    • Single-stranded satellite RNA
    • RNA satellite
    • 未定属

类病毒(Viroids)

朊毒体(Prions)

  • Mammal-prion
  • Fungi-prion

干扰缺损病毒(Defective Interfering)

  • 缺损干扰 RNA Defective Interfering RNA
  • Defective interfering particle

参考文献

  1. Fields p. 27
    • As defined therein, "a virus species is a polythetic class of viruses that constitute a replicating lineage and occupy a particular ecological niche". A“polythetic" class is one whose members have several properties in common, although they do not necessarily all share a single common defining one. Members of a virus species are defined collectively by a consensus group of properties. Virus species thus differ from the higher viral taxa, which are“universal”classes and as such are defined by properties that are necessary for membership.
  2. Delwart, E.L. Viral metagenomics. Rev. Med. Virol.. 2007, 17 (2): 115–131. PMID 17295196. doi:10.1002/rmv.532. 
  3. ICTV Code. talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. [2020-04-26]. 
  4. Virus Taxonomy: 2022 Release. talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. [2022-07-26]. 
  5. Baltimore, D. The strategy of RNA viruses. Harvey Lect.. 1974,. 70 Series: 57–74. PMID 4377923. 
  6. van Regenmortel, M.H.; Mahy, B.W. Emerging issues in virus taxonomy. Emerging Infect. Dis.. 2004, 10 (1): 8–13. PMID 15078590. 
  7. Mayo, M.A. Developments in plant virus taxonomy since the publication of the 6th ICTV Report. International Committee on Taxonomy of Viruses. Arch. Virol.. 1999, 144 (8): 1659–1666. PMID 10486120. doi:10.1007/s007050050620. 
  8. de Villiers, E.M.; Fauquet, C.; Broker, T.R.; Bernard, H.U. & zur Hausen, H. Classification of papillomaviruses. Virology. 2004, 324 (1): 17–27. PMID 15183049. doi:10.1016/j.virol.2004.03.033.