系统生物学：修订间差异

== 歷史 ==

2001年第二屆國際系統生物學會（2nd International Conference on Systems Biology；ICSB 2001）對”系統生物學”的解釋為：系統生物學是對生物體整個過程做一全面性的定量研究，並非以生物體的某一部分為對象。目的是要建立模式並以實驗來證實其可預測的生物體的表現)。簡單的說，這樣的研究方法就是利用資訊科學及微機電工程的技術來研究生物學的問題，最後並希望能夠利用電腦運算的結果，來預測細胞、器官、系統甚至完整生物體的表現。

最先把DNA测序自動化，同時也是1985年首先推動基因体計畫的科學家之一的{{link-en|萊諾伊·胡德|Leroy Hood}}（Leroy Hood）博士2000年最早建立系統生物學研究所，並認為系統生物學是研究一個生物系統內所有組成份的構成，以及在特定條件下這些組成份相互關係的學科。並在2000年1月與{{link-en|阿蘭·阿德雷姆|Alan Aderem}}及{{link-en|魯迪·艾伯索爾德|Ruedi Aebersold}}等學者創立一個非營利性質的研究機構：系統生物學研究所（Institute for Systems Biology），致力於系統生物學在生命科學相關領域的研究與應用。

{{link-en|萊諾伊·胡德|Leroy Hood}}博士在2001年3月訪問台灣時，對系統生物學曾有以下的描述：系統生物學是將DNA、RNA、蛋白質以及三者彼此之間的交互作用等資訊加以整合，並運用這些資料去建立出數學計量模型，以期能掌握所有生物基因與組織間的關係及運作。因此系統生物學的研究過程是先取得一個生物、組織或細胞系統，辨識出各種內部因素，在獲得DNA、RNA及蛋白質相互作用及資訊網路方面整合所獲得的資訊，然後开发出能描述系統結構和行為的數學模型，最後可以藉由此一個模型系統，使這個系統可以自動執行所需的功能。因此系統生物學是結合許多不同學科的領域，透過彼此相互的網狀合作，針對一個生物現象所進行的研究。

而{{le|北野宏明|Hiroaki Kitano}}（Hiroaki Kitano）博士認為系統生物學的研究可以包含四大部分，分別利用資訊科學、分析、技術、[[基因组學]]四者形成環型而連續的關係，建立出一個新的研究模式<ref>（Kitano, 2002）</ref>，並且利用這一模式所發展的一系列的工具來解決生物學家所面臨的研究問題。<ref>[曾湘文，2005]</ref>

:在有機體的，組織的或細胞水平上的[[基因表現]]的量測，通過[[DNA微陣列]]或{{le|基因表達系列分析|Serial analysis of gene expression}}。

:在有機體的，組織的或細胞水平上的被稱為[[代謝產物]]的小分子的量測。

:在有機體的，組織的或細胞水平上的[[醣類]]的量測。

:在有機體的，組織的或細胞水平上的[[脂质]]的量測。

:在有機體的，組織的或細胞水平上的分子間相互作用的研究。

:在有機體的，組織的或細胞水平上的分子隨時間變化的動態變化的量測。