演化：修订间差异

{{about|演化的基础概念|同名电子游戏|进化 (游戏)|其他以演化為名的條目|演化 (消歧義)}}

{{redirect-multi|2|演化論|进化论|其他用法|进化论 (消歧义)}}

-{zh-hans:'''进化'''，又称'''演化''';zh-cn:'''进化'''，又称'''演化''';zh-hant:'''進化'''，又稱'''演化''';zh-hk:'''進化'''，又稱'''演化''';zh-tw:'''演化'''，前譯'''進化''';zh-sg:'''进化'''，又称'''演化''';zh-mo:'''進化'''，又稱'''演化''';}-（{{lang-en|'''evolution'''}}），指的是生物的可遺傳[[性狀]]在世代間的改變<ref>{{harvnb|Hall|Hallgrímsson|2008|pp=4–6}}</ref><ref>{{cite web|title=Evolution Resources|publisher=National Academies of Sciences, Engineering, and Medicine|year=2016|url=http://www.nas.edu/evolution/index.html|accessdate=2016-06-16|||}}</ref>，操作定義是[[種群]]內[[基因頻率]]的改變。基因在[[繁殖]]過程中，會經複製並傳遞到子代。而基因的[[突变]]可使性狀改變，進而造成個體之間的[[遺傳變異]]。新性狀又會因為物種[[迁徙]]或是物種之間的[[基因水平轉移|水-{平}-基因轉移]]，而隨著基因在族群中傳遞。當這些遺傳變異受到非隨機的[[自然选择]]或隨機的[[遺傳漂變]]影響，而在族群中變得較為普遍或稀有時，就是演化。演化會引起生物各個層次的多樣性，包括[[物種]]、[[生物]]個體和[[分子演化|分子]]<ref>{{harvnb|Hall|Hallgrímsson|2008|pp=3–5}}</ref>

[[地球]]上所有[[生命]]的[[共同起源]]，約35-38億年前出現<ref name="Origin1">{{cite journal |last1=Schopf |first1=J. William ||last2=Kudryavtsev |first2=Anatoliy B. |last3=Czaja |first3=Andrew D. |last4=Tripathi |first4=Abhishek B. |date=2007-10-05 |title=Evidence of Archean life: Stromatolites and microfossils |journal=[[Precambrian Research]] |location=Amsterdam, the Netherlands |publisher=Elsevier |volume=158 |pages=141–155 |issue=3–4 |doi=10.1016/j.precamres.2007.04.009 |issn=0301-9268}}</ref>，稱為[[最後共同祖先]]<ref name="Kampourakis2014">{{harvnb|Kampourakis|2014|pp=127–129}}</ref><ref name="Doolittle_2000">{{cite journal |last=Doolittle |first=W. Ford ||date=February 2000 |title=Uprooting the Tree of Life |url=http://shiva.msu.montana.edu/courses/mb437_537_2004_fall/docs/uprooting.pdf |format=PDF |journal=[[Scientific American]] |location=Stuttgart |publisher=[[Georg von Holtzbrinck Publishing Group]] |volume=282 |issue=2 |pages=90–95 |doi=10.1038/scientificamerican0200-90 |issn=0036-8733 |pmid=10710791 |||accessdate=2015-04-05}}</ref><ref>{{cite journal |last1=Glansdorff |first1=Nicolas |author2=Ying Xu |last3=Labedan |first3=Bernard |date=2008-07-09 |title=The Last Universal Common Ancestor: emergence, constitution and genetic legacy of an elusive forerunner |journal=[[Biology Direct]] |location=London |publisher=[[BioMed Central]] |volume=3 |page=29 |doi=10.1186/1745-6150-3-29 |issn=1745-6150 |pmc=2478661 |pmid=18613974}}</ref>。之後新物種（[[物种形成|物種形成]]）、種內的變化（{{le|前進演化| Anagenesis }}）和物種的消失（[[絕種]]）在整個地球的{{le|生命進化史| Evolutionary history of life }}不斷發生。據估計，曾經生活在地球上的物種99％以上已經滅絕<ref name="StearnsStearns1999">{{harvnb|Stearns|Stearns|1999|p=x}}</ref><!-- removed_ref site196 by WaitSpring-bot (template) -->。地球目前的物種估計有1000萬至1400萬<ref name="MillerSpoolman2012">{{harvnb|Miller|Spoolman|2012|p=62}}</ref>。其中約120萬已被記錄<ref name="PLoS-20110823">{{cite journal |last1=Mora |first1=Camilo |last2=Tittensor |first2=Derek P. |last3=Adl |first3=Sina |last4=Simpson |first4=Alastair G. B. |last5=Worm |first5=Boris ||display-authors=3 |date=2011-08-23 |title=How Many Species Are There on Earth and in the Ocean? |journal=[[PLOS Biology]] |location=San Francisco, CA |publisher=[[PLOS|Public Library of Science]] |volume=9 |issue=8 |page=e1001127 |doi=10.1371/journal.pbio.1001127 |issn=1545-7885 |pmc=3160336 |pmid=21886479}}</ref>。

以自然選擇為基礎的演化[[理論]]，最早是由[[查爾斯·達爾文]]與[[阿弗雷德·羅素·華萊士|亞爾佛德·羅素·華萊士]]所提出，詳細闡述出現在達爾文出版於1859年的《[[物種起源]]》<ref name=Darwin>{{cite book en |last=Darwin |first=Charles |year=1859 |title=On the Origin of Species |place=London |publisher=John Murray |edition=1st |pages=p. 1 |url=http://darwin-online.org.uk/content/frameset?itemID=F373&viewtype=text&pageseq=16 |access-date=2007-07-23 |||}}. Related earlier ideas were acknowledged in {{cite book en |last=Darwin |first=Charles ||year=1861 |title=On the Origin of Species |place=London |publisher=John Murray |edition=3rd |pages=p. xiii |url=http://darwin-online.org.uk/content/frameset?itemID=F381&viewtype=text&pageseq=20 |access-date=2007-07-23 |||}}</ref>。1930年代，[[查爾斯·達爾文|達爾文]][[自然选择|自然選擇]]與[[孟德爾]][[遺傳]]合而為一，形成了[[现代演化综论|現代綜合理論]]<ref name="understandingevolution" />。連結了演化的「單位」（[[基因]]）與演化的「機制」（自然選擇）。這種有力的解釋以及具預測性的理論成為現代生物學的中心原則，使地球上的[[生物多樣性]]得以作統一的解釋<ref>{{cite web|url=http://www.interacademies.net/Object.File/Master/6/150/Evolution%20statement.pdf |title=IAP Statement on the Teaching of Evolution |date=2006 |publisher=The Interacademy Panel on International Issues |accessdate=2007-04-25 |||}}<br />*{{cite web|url=http://www.aaas.org/news/releases/2006/pdf/0219boardstatement.pdf |date=2006 |title=Statement on the Teaching of Evolution |publisher=[[美國科學促進會]] |accessdate=2007-04-25 |||}}</ref>。

[[自然选择|自然選擇]]能使有利於生存與繁殖的遺傳性狀變得更為普遍，並使有害的性狀變得更稀有。這是因為帶有較有利性狀的個體，能將相同的性狀轉移到更多的後代<ref name="Futuyma" /><ref name="Lande">{{Cite journal |author = Lande R, Arnold SJ |year = 1983 |title = The measurement of selection on correlated characters ||journal = Evolution |volume = 37 |pages = 1210–26 |doi = 10.2307/2408842}}</ref>。經過了許多世代之後，性狀產生了連續、微小且隨機的變化，自然選擇則挑出了最適合所處環境的變異，使[[適應]]得以發生<ref name="understandingevolution">{{cite web |url = http://evolution.berkeley.edu/evolibrary/article/0_0_0/evo_14 |title = Mechanisms: the processes of evolution |accessdate = 2006-07-14 |work = Understanding Evolution |publisher = [[University of California, Berkeley]] |||}}</ref>。相對而言，遺傳漂變會使性狀在族群中的所佔比例產生一些隨機的變化，來自一些使個體能夠成功繁殖的偶然因素。此外，[[定向演化]]、{{le|進化主義| evolutionism }}、與生俱來的「進步」傾向中沒有{{le|最大規模的演化趨勢| Largest-scale trends in evolution}}等關於演化原有的概念，已經變得{{le|過時| Superseded scientific theories }}<ref>{{harvnb|Provine|1988|pp=49–79}}</ref>。科學家們繼續提出和測試假說，以研究[[演化生物学]]的不同範疇，建構[[數理生物學|數學及理論生物學]]和生物學理論，使用[[观察性研究|觀測得來的數據]]，並在[[動物棲地|生境]]和[[實驗室]]進行[[實驗]]。

在實際應用方面，演化論已經應用到眾多科學和工業領域，包括[[農業]]、[[医学|人类]]、[[兽医学]]和[[生命科學]]的發展<ref>[[#NAS 2008|NAS 2008]], [http://www.nap.edu/openbook.php?record_id=11876&page=R11 pp. R11–R12]</ref><ref>{{harvnb|Ayala|Avise|2014}}{{page needed|date=September 2015}}</ref><ref>[[#NAS 2008|NAS 2008]], [http://www.nap.edu/openbook.php?record_id=11876&page=17 p. 17]</ref>。進化生物學的發現不只是影響生物學，而且對其他學科有不少影響，包括[[体质人类学|生物人類學]]、[[演化心理學]]。一个[[人工智能]]的分支，[[进化计算]]，是以達爾文的概念應用於[[計算機科學]]的結果。

目前已有壓倒性的證據支持演化的真實性，學界普遍認為演化是事實，而不僅僅是理論或假說，對於演化論的真確性，存在有強烈的科學共識，演化以外任何關於物種起源或人類起源的學說，目前都不獲支持。絕大多數的科學社群和學術團體，都認為演化論是唯一能完全滿足在[[生物學]]、[[古生物學]]、[[分子生物學]]、[[遺傳學]]、[[人類學]]及其他各領域中所觀察到的現象的理論。<ref>{{cite news | first=PZ | last=Myers | | title=Ann Coulter: No evidence for evolution? | date=2006-06-18 | publisher=scienceblogs.com | url=http://scienceblogs.com/pharyngula/2006/06/ann_coulter_no_evidence_for_ev.php | work=Pharyngula | pages= | accessdate=2006-11-18 | | | | df= }}</ref><ref>The [[National Science Teachers Association]]'s [http://www.nsta.org/159%26psid%3D10 position statement on the teaching of evolution.]</ref><ref>[http://www.interacademies.net/10878/13901.aspx IAP Statement on the Teaching of Evolution] Joint statement issued by the national science academies of 67 countries, including the [[United Kingdom|United Kingdom's]] [[Royal Society]] (PDF file)</ref><ref name="AAAS Denounces Anti-Evolution Laws">From the [[American Association for the Advancement of Science]], the world's largest general scientific society: [http://www.aaas.org/news/releases/2006/pdf/0219boardstatement.pdf 2006 Statement on the Teaching of Evolution] (PDF file), [http://www.aaas.org/news/releases/2006/0219boardstatement.shtml AAAS Denounces Anti-Evolution Laws]</ref><ref name=factfancy>[https://www.jstor.org/stable/2743476 ''Fact, Fancy, and Myth on Human Evolution'', Alan J. Almquist, John E. Cronin, Current Anthropology, Vol. 29, No. 3 (Jun., 1988), pp. 520–522]</ref>一項在1991年所作的蓋洛普民調顯示，有大約55%的科學家（包括生物學領域以外的其他科學家）認為自己是无神论者。<ref name=robinson>{{Cite web |url=http://www.religioustolerance.org/ev_publi.htm |title=''Public beliefs about evolution and creation'', Robinson, B. A. 1995. |accessdate=2018-10-01 |||}}</ref><ref>[http://ncse.com/rncse/17/6/many-scientists-see-gods-hand-evolution ''Many scientists see God's hand in evolution'', Witham, Larry, Reports of the National Center for Science Education 17(6): 33, 1997]</ref>截至目前為止，沒有任何反對演化論且經過科學方面同行審查的論文，名列科學與醫學期刊搜尋引擎[[PubMed]]當中。<ref name="pmid16670753">{{cite journal | author=Attie AD | title=Defending science education against intelligent design: a call to action | | journal=J Clin Invest | date= 2006 | volume= 116 | issue= 5 | pages= 1134–8 | pmid=16670753 | doi=10.1172/JCI28449 | pmc=1451210 |name-list-format=vanc| author2=Sober E | author3=Numbers RL | author4=Amasino RM | author5=Cox B | author6=Berceau T | display-authors=6 | last7=Powell | first7=T | last8=Cox | first8=MM }}</ref>

雖然演化論有科學和考古支持，但由於缺乏可靠的[[歷史]][[文獻]]，[[歷史學]]家一般不會視演化論為[[信史|可信的歷史]]。生命的演化史和[[人類演化|人類的演化史]]，不屬[[信史]]範疇，並被視作[[史前時代|史前史學]]。<ref>{{Cite web |url=http://www.cqvip.com/qk/81270x/201603/669047570.html |title=''考古发现与民族认同——以民国时期中国历史教科书为中心 |author=《复旦学报：社会科学版》2016年 第3期 |4= |accessdate=2017-01-01 |||}}</ref><ref>{{Cite web|url=http://www.cqvip.com/qk/83721x/201203/43671723.html|title=''由甲骨文“周祭”“贡典祭”论上甲六示为商族信史时代的开始|author=《烟台大学学报：哲学社会科学版》2012年 第3期|4=|accessdate=2014-01-01|||}}</ref>

在《物種起源》最初的版本中沒有出現「Evolution」這個詞，[[查爾斯·達爾文|達爾文]]用「經過改變的繼承」（{{Lang|en|descent with modification}}）、「改變過程」（{{Lang|en|process of modification}}）或是「物種改變的原理」（{{Lang|en|doctrine of the modification of species}}）等。他曾在《物種起源》第7章中說，天擇的最後結果，包括了生物體的進步（{{Lang|en|advance}}）及退步（{{Lang|en|retrogression}}）兩種現象」，而總括來說，從地球有生物開始，是進步或退步的問題放在第10章討論，結論是現有的生物都是經過長時間的進步，到某程度而沒有違反天擇的，發展便停留下來。只有在全書的最後一句以「evolved」這個字結尾<ref name="darwinevolution">{{cite web | url=http://www.etymonline.com/index.php?term=evolve | title=Etymology of Evolution}}</ref><ref>{{cite book |title=The origin of species by means of natural selection, or the preservation of favoured races in the struggle for life |last=Darwin |first=Charles ||coauthors= |year=1876 |publisher=John Murray |location=London |isbn= |page= |pages= |url=http://darwin-online.org.uk/contents.html#origin |accessdate=2010-08-08 |||}}</ref>：

{{cite book |title=中山先生的世界觀 |last=段雲章 ||coauthors= |year= |publisher=秀威資訊科技股份有限公司 |location= |isbn=9862213612 |page=第四頁 |pages= ||accessdate=2010-08-08 }}

</ref>。除了台灣之外，「進-{}-化」一詞沿用至今。台灣的學者<ref>{{Cite journal|title=碩士論文：清末民初的達爾文進-{}-化論|url=http://ir.lib.nthu.edu.tw/dspace/handle/987654321/23590|last=崔小茹|year=1988|publisher=國立清華大學|accessdate=2010-08-08|docket=|oclc=|||}}

</ref>、政府機構<ref>{{Cite journal | |title=進-{}-化論與近代中國的倫理思想 |url=http://ntur.lib.ntu.edu.tw/bitstream/246246/4424/1/912411H002066.pdf |last=楊芳燕 |year=2004 |publisher=行政院國家科學委員會專題研究計畫成果報告 |accessdate=2010-08-08 |docket= |oclc= }}

</ref>、教科書等<ref name=sciencedev>{{cite journal|author=陳恒安|first1=|last2=|first2=|year=2009|title=高中歷史課本中的達爾文及進-{}-化論|journal=科學發展|publisher=|volume=|issue=442|pages=第85頁|url=http://ejournal.stpi.org.tw/NSC_INDEX/Journal/EJ0001/9810/9810-15.pdf|doi=|||}}

| direction = vertical

| width = 175

| footer =

| image1 = Lucretius Rome.jpg

| caption1 = [[卢克莱修]]

| image2 = Charles Darwin aged 51.jpg

| caption2 = 1842年，[[查尔斯·达尔文|查爾斯·達爾文]]寫出了物種起源的第一份草稿<ref>{{harvnb|Darwin|1909|p=53}}</ref>。

| image3 = Alfred-Russel-Wallace-c1895.jpg

| caption3 = [[阿尔弗雷德·拉塞尔·华莱士]]

早在[[古希腊|古希臘時代]]，類似演化的思想已經出現，例如[[前苏格拉底哲学|前蘇格拉底哲學家]][[阿那克西曼德]]及[[恩培多克勒]]認為一種[[生物]]可以源於另一種生物<ref>{{harvnb|Kirk|Raven|Schofield|1983|pp=100–142, 280–321}}</ref>。這種思想一直延續到羅馬時代，繼恩培多克勒之後，[[盧克萊修]]在他的作品《[[物性論]]》中也提及類似演化的思想<ref name="Carus2011">{{cite book |author=Lucretius ||chapter=Book V, lines 855–877 ||title=[[De rerum natura|De Rerum Natura]] |website=[[Perseus Project|Perseus Digital Library]] |others=Edited and translated by [[William Ellery Leonard]] (1916) |location=Medford/Somerville, MA |publisher=[[Tufts University]] |oclc=33233743 |accessdate=2014-11-25 |||}}</ref><ref>{{cite journal|last=Sedley |first=David ||year=2003 |title=Lucretius and the New Empedocles |url=http://lics.leeds.ac.uk/2003/200304.pdf |format=PDF |journal=Leeds International Classical Studies |location=Leeds, West Yorkshire, England |publisher=[[University of Leeds|Leeds International Classics Seminar]] |volume=2 |issue=4 |issn=1477-3643 |accessdate=2014-11-25 |||}}</ref>。相對於這些[[唯物主义|唯物主義]]的思想，[[亞里士多德]]了解不僅是活的東西，對一切自然的東西而言，演化是對不同的自然可能性的一種不完美實現，如[[理型論|理型]]、[[唯心主義|理念]]、物种<ref name="Torrey37">{{cite journal |last1=Torrey |first1=Harry Beal |last2=Felin |first2=Frances |date=March 1937 |title=Was Aristotle an Evolutionist? ||journal=[[The Quarterly Review of Biology]] |volume=12 |issue=1 |pages=1–18 |doi=10.1086/394520 |issn=0033-5770 |jstor=2808399}}</ref><ref name="Hull67">{{cite journal |last=Hull |first=David L. ||date=December 1967 |title=The Metaphysics of Evolution |journal=[[The British Journal for the History of Science]] |location=Cambridge |publisher=[[Cambridge University Press]] |volume=3 |issue=4 |pages=309–337 |doi=10.1017/S0007087400002892 |jstor=4024958}}</ref>。這是他理解大自然[[目的論]]的一部分：一切事物都在{{le|神聖的| Divinity }}[[宇宙 (系统)|宇宙]]秩序中發揮預期作用。在[[中世紀]]，這種思想的變體成為標準理解和被納入[[基督教]]的知識，但亞里士多德沒有要求生物體總是對應形而上一對一的形式和沒有就新生物的産生給出具體例子<ref>{{harvnb|Mason|1962|pp=43–44}}</ref>

* {{harvnb|Ray|1686}}</ref>。他認為這些物種是上帝設計的，但表現出局部條件的差異。在[[卡爾·林奈]]於1735年引入的生物分類中，其明確承認種關係的分層特性，但根據「上帝的計劃」物種仍被視為不變<ref>{{cite web |url=http://www.ucmp.berkeley.edu/history/linnaeus.html |title=Carl Linnaeus (1707-1778) |last=Waggoner |first=Ben |date=2000-07-07 |website=Evolution |publisher=[[University of California Museum of Paleontology]] |location=Berkeley, CA |type=Online exhibit |accessdate=2012-02-11 |||}}</ref>。

同期的其他[[自然历史|博物學家]]根據自然規律，推斷出物種会隨時間演變。1751年，[[皮埃爾·莫佩爾蒂]]寫道透过繁殖和多代累積的自然變更，会產生新的物種<ref>{{harvnb|Bowler|2003|pp=73–75}}</ref>。[[布丰|喬治-路易·勒克萊爾，布豐伯爵]]認為物種可以蛻化成不同的生物，[[伊拉斯謨斯·達爾文]]則提出所有[[恒温动物|恆溫動物]]可能是單一[[微生物]]的後裔<ref>{{cite web |url=http://www.ucmp.berkeley.edu/history/Edarwin.html |title=Erasmus Darwin (1731-1802) |date=1995-10-04 |website=Evolution |publisher=University of California Museum of Paleontology |location=Berkeley, CA |type=Online exhibit |accessdate=2012-02-11 |||}}</ref>。1809年，[[让-巴蒂斯特·拉马克|拉马克]]提出第一個全面的進化機制，其猜想[[自然發生]]在具有固定的漸進趨勢的平行世系中不斷地把簡單的生命變為更複雜的生命，並推測在局部的層面，下一代会通過遺傳他們父母用進廢退的器官以適應環境<ref name="Nardon_Grenier91">{{harvnb|Nardon|Grenier|1991|p=162}}</ref><ref name="Gould02">{{harvnb|Gould|2002}}{{page needed|date=December 2013}}</ref>。（後一方法後來被稱為[[拉馬克主義]]<ref name="Nardon_Grenier91" /><ref name="ImaginaryLamarck">{{cite journal |last=Ghiselin |first=Michael T. ||date=September–October 1994 |title=The Imaginary Lamarck: A Look at Bogus 'History' in Schoolbooks |url=http://www.textbookleague.org/54marck.htm |journal=The Textbook Letter |location=Sausalito, CA |publisher=The Textbook League |oclc=23228649 |accessdate=2008-01-23 |author= |||}}</ref><ref>{{harvnb|Magner|2002}}{{page needed|date=December 2013}}</ref><ref name="Jablonka07">{{cite journal |last1=Jablonka |first1=Eva ||last2=Lamb |first2=Marion J. ||date=August 2007 |title=Précis of Evolution in Four Dimensions |journal=[[Behavioural and Brain Sciences]] |location=Cambridge |publisher=Cambridge University Press |volume=30 |issue=4 |pages=353–365 |doi=10.1017/S0140525X07002221 |issn=0140-525X}}</ref>。）這些想法受博物學家譴責，因為這些推測缺乏實證支持。尤其[[喬治·居維葉]]堅持認為種是不相關的並不變，它們的相似只是反映了上帝為了其功能需求的設計。英國牧師[[威廉·佩利 (哲学家)|威廉·佩利]]把林奈的思想在《{{le|自然神学|Natural Theology or Evidences of the Existence and Attributes of the Deity}}》中進一步發展，其中提出複雜的適應度是上帝所設計，這亦是查爾斯·達爾文推崇的證據<ref name="Darwin91">{{harvnb|Burkhardt|Smith|1991}}

* {{cite web |url=http://www.darwinproject.ac.uk/letter/entry-2532 |title=Darwin, C. R. to Lubbock, John |website=[[Correspondence of Charles Darwin#Darwin Correspondence Project website|Darwin Correspondence Project]] |publisher=[[University of Cambridge]] |location=Cambridge, UK |accessdate=2014-12-01 |||}} Letter 2532, November 22, 1859.</ref><ref name="Sulloway09">{{cite journal |last=Sulloway |first=Frank J. ||date=June 2009 |title=Why Darwin rejected intelligent design |journal=[[Journal of Biosciences]] |location=Bangalore |publisher=Indian Academy of Sciences |volume=34 |issue=2 |pages=173–183 |doi=10.1007/s12038-009-0020-8 |issn=0250-5991 |pmid=19550032}}</ref><ref name="Dawkins90">{{harvnb|Dawkins|1990}}{{page needed|date=December 2014}}</ref>。

自然選擇理論是一个關鍵理念把不變類型學或生物類型的概念打破，這是達爾文部分受到[[托马斯·罗伯特·马尔萨斯|馬爾薩斯]]的《[[人口論]]》影響而建立的理論，達爾文指出，人口增長會導致「生存鬥爭」，有利的變化佔了上風，其他的則死去。每代中，很多子女因有限的資源而在達至生殖年齡前無法生存，這可以解釋共同祖先透过自然法則以同樣方式對待所有有機體演化而來的植物和動物的多樣性<ref name="Sober09">{{cite journal |last=Sober |first=Elliott ||date=2009-06-16 |title=Did Darwin write the ''Origin'' backwards? |journal=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |location=Washington, D.C. |publisher=National Academy of Sciences |volume=106 |issue=Suppl. 1 |pages=10048–10055 |bibcode=2009PNAS..10610048S |doi=10.1073/pnas.0901109106 |issn=0027-8424}}</ref><ref>{{harvnb|Mayr|2002|p=165}}</ref><ref>{{harvnb|Bowler|2003|pp=145–146}}</ref><ref>{{cite journal |last1=Sokal |first1=Robert R. ||last2=Crovello |first2=Theodore J. |date=March–April 1970 |title=The Biological Species Concept: A Critical Evaluation |journal=[[The American Naturalist]] |location=Chicago, IL |publisher=[[University of Chicago Press]] on behalf of the [[American Society of Naturalists]] |volume=104 |issue=936 |pages=127–153 |doi=10.1086/282646 |issn=0003-0147 |jstor=2459191}}</ref>。從1838年起，達爾文逐步建立了他的「自然選擇」理論，在1858年，當華萊士給他發了一封理論幾乎相同的的信時，他正在編寫關於這个議題的「著作」。他們倆的共同論文「{{le|论物种形成变种的倾向；以及论这些变种和物种经由自然选择之手段而得以延续的方式|On the Tendency of Species to form Varieties; and on the Perpetuation of Varieties and Species by Natural Means of Selection}}」在1858年的[[倫敦林奈學會]]上發表<ref>{{cite journal |last1=Darwin |first1=Charles ||last2=Wallace |first2=Alfred ||date=1858-08-20 |title=On the Tendency of Species to form Varieties; and on the Perpetuation of Varieties and Species by Natural Means of Selection |url=http://darwin-online.org.uk/content/frameset?itemID=F350&viewtype=text&pageseq=1 |journal=[[Zoological Journal of the Linnean Society|Journal of the Proceedings of the Linnean Society of London. Zoology]] |volume=3 |issue=9 |pages=45–62 |doi=10.1111/j.1096-3642.1858.tb02500.x |issn=1096-3642 |accessdate=2007-05-13 |||}}</ref>。在1859年年底，達爾文關於其「理論」的出版物《物種起源》詳細解釋自然選擇及其機制，造成日後漸為人接受的[[達爾文主義|進化概念]]。[[托马斯·亨利·赫胥黎]]把達爾文的思想應用至[[人類]]，並利用[[古生物學]]和[[比較解剖學]]，去證明人類和[[猿|類人猿]]有著共同的祖先。有些人對這種思想感到不安，因為它暗示人類在宇宙中並沒有特殊的地位<ref>{{cite encyclopedia |last=Desmond |first=Adrian J. ||encyclopedia=[[Encyclopædia Britannica Online]] |url=http://www.britannica.com/EBchecked/topic/277746/Thomas-Henry-Huxley |title=Thomas Henry Huxley |accessdate=2014-12-02 |date=2014-07-17 |publisher=[[Encyclopædia Britannica, Inc.]] |location=Chicago, IL |||}}</ref>。

生殖遺傳和新性狀起源的確切機制仍然是個謎，為此達爾文曾提出他的臨時學說[[泛生論]]<ref name="Liu09">{{cite journal |last1=Liu |first1=Y. S. |last2=Zhou |first2=X. M. |last3=Zhi |first3=M. X. |last4=Li |first4=X. J. |last5=Wang |first5=Q. L. |date=September 2009 |title=Darwin's contributions to genetics |journal=Journal of Applied Genetics |location=Poznań |publisher=Institute of Plant Genetics, [[Polish Academy of Sciences]] |volume=50 |issue=3 |pages=177–184 |doi=10.1007/BF03195671 |issn=1234-1983 |pmid=19638672}}</ref>。1865年，[[孟德爾]]遺傳性狀是在可預測的方式，通過元素的自由組合(孟德爾第二法則)和分離遺傳(該元素後來被稱為[[基因]])，[[孟德爾遺傳定律]]最終取代大部分達爾文的泛生學說<ref name="Weiling">{{cite journal |last=Weiling |first=Franz |date=July 1991 |title=Historical study: Johann Gregor Mendel 1822–1884 |journal=[[American Journal of Medical Genetics]] |volume=40 |issue=1 |pages=1–25; discussion 26 |doi=10.1002/ajmg.1320400103 |pmid=1887835}}</ref>。[[奥古斯特·魏斯曼|奧古斯特·魏斯曼]]提出產生可產生[[配子]]的[[生殖细胞]](如[[精子]]和[[卵子细胞|卵子細胞]])和身體的[[体细胞|體細胞]]之間的重要區別，這表明遺傳只經[[生殖細胞系]]發生。[[许霍·德弗里斯]]把達爾文的泛生論連接至魏斯曼的發現並提出達爾文的泛生論應集中於[[細胞核]]，他表示細胞核可以移動到細胞質去改變細胞結構。德弗里斯也是令孟德爾的研究知名的研究人員之一，認為孟德爾性狀對應於沿種系的遺傳變異傳遞<ref name="Wright84">{{harvnb|Wright|1984|p=480}}</ref>。為了解釋新變種如何起源，德弗里斯制定了一個突變理論，導致與德弗里斯同陣的生物統計學派(Biometricians)及達爾文的進化論出現暫時性裂痕<ref name=Gould02/>{{harvnb|Provine|1971}}</ref><ref>{{cite journal |last1=Stamhuis |first1=Ida H. |last2=Meijer |first2=Onno G. |last3=Zevenhuizen |first3=Erik J. A. |date=June 1999 |title=Hugo de Vries on Heredity, 1889-1903: Statistics, Mendelian Laws, Pangenes, Mutations ||volume=90 |issue=2 |pages=238–267 |journal=[[Isis (journal)|Isis]] |location=Chicago, IL |publisher=University of Chicago Press |doi=10.1086/384323 |issn=0021-1753 |jstor=237050 |pmid=10439561}}</ref>。20世紀30年代，群体遺傳學領域的先驅如[[羅納德·費雪]]、[[生物學家]][[休厄尔·赖特]]與[[约翰·伯顿·桑德森·霍尔丹]]把演化建基於健全的統計學理念上，因此，達爾文的學說、基因突變和[[孟德尔定律]]之間的偽矛盾被調和<ref>{{harvnb|Quammen|2006}}{{page needed|date=December 2014}}</ref>。

進化論是近代西方思想較早引介到中國，發生絕大影響；中國人逐漸相信，進化是宇宙之鐵則；[[社會達爾文主義]]伴隨而來，人們對進化論了解片面，辯證法思想豐富人們觀念內容和符合實際發展<ref name=總序>{{cite book |editors=《中國近代思想家文庫》編纂委員會 |year=2014 |title=《中國近代思想家文庫》 |chapter=〈總序〉 |location=北京 |publisher=中國人民大學出版社 }}</ref>{{rp|2}}。

在20世紀20年代至30年代，[[現代演化綜論]]把自然選擇、基因突變理論、孟德爾遺傳定律連結起來，形成普遍適用於生物學任何分支的統一理論。現代演化綜論能夠通過古生物的[[過渡化石]]，以至在[[發育生物學]]中的複雜細胞機制，解釋在種群的不同物種所觀察到的模式<ref name="Gould02" /><ref>{{harvnb|Bowler|1989}}{{page needed|date=December 2013}}</ref>。由[[詹姆斯·杜威·沃森|詹姆斯·沃森]]和[[弗朗西斯·克里克]]在1953年公佈的[[脱氧核糖核酸]]結構展示了遺傳的物理機制<ref name="Watson53">{{cite journal |last1=Watson |first1=J. D. ||last2=Crick |first2=F. H. C. ||date=1953-04-25 |title=Molecular Structure of Nucleic Acids: A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid |url=http://profiles.nlm.nih.gov/SC/B/B/Y/W/_/scbbyw.pdf |format=PDF |journal=[[Nature (journal)|Nature]] |location=London |publisher=Nature Publishing Group |volume=171 |issue=4356 |pages=737–738 |bibcode=1953Natur.171..737W |doi=10.1038/171737a0 |issn=0028-0836 |pmid=13054692 |accessdate=2014-12-04 |quote=It has not escaped our notice that the specific pairing we have postulated immediately suggests a possible copying mechanism for the genetic material. |||}}</ref>。[[分子生物學]]提高了我們對[[基因型]]和[[表現型]]之間的關係的理解。進展也在[[系统发生学|譜系]][[系統分類學]]中體現，在對比中繪製過渡的性狀、经發佈的可測試框架、和使用[[系統發生樹|演化樹]]<ref name="Hennig99">{{harvnb|Hennig|1999|p=280}}</ref><ref name="Wiley11">{{harvnb|Wiley|Lieberman|2011}}{{page needed|date=December 2013}}</ref>。1973年，演化生物學家[[费奥多西·多布然斯基|費奧多西·多布然斯基]]在一篇文章寫下「[[生物學的一切都沒有道理，除非放在演化的光芒之下]]」，因為它令起初似乎不連貫的自然歷史聯繫起來，轉化成連貫的知識體系，形容並預測許多关於在這個星球上的生命所觀察到的事實<ref name="Dobzhansky73">{{cite journal |last=Dobzhansky |first=Theodosius ||date=March 1973 |title=[[Nothing in Biology Makes Sense Except in the Light of Evolution]] |journal=The American Biology Teacher |location=McLean, VA |publisher=[[National Association of Biology Teachers]] |volume=35 |issue=3 |pages=125–129 |doi=10.2307/4444260}}</ref>。

此後，現代演化綜論得到了進一步的擴展，至解釋完整橫跨生物層級及綜合範圍的{{le|生物現象|Biological organisation}}：從基因至物種。此擴展，如[[演化發育生物學]]，或簡稱為演化發生學，強調世代之間的變化（進化）是如何影響生物個體的模式<ref name="Kutschera">{{cite journal |last1=Kutschera |first1=Ulrich ||last2=Niklas |first2=Karl J. ||date=June 2004 |title=The modern theory of biological evolution: an expanded synthesis |journal=[[Naturwissenschaften]] |location=Heidelberg |publisher=[[Springer Science+Business Media|Springer-Verlag Heidelberg]] |volume=91 |issue=6 |pages=255–276 |bibcode=2004NW.....91..255K |doi=10.1007/s00114-004-0515-y |issn=1432-1904 |pmid=15241603}}</ref><ref>{{harvnb|Cracraft|Bybee|2005}}{{page needed|date=December 2014}}</ref><ref name="Avise10">{{cite journal |last1=Avise |first1=John C. ||last2=Ayala |first2=Francisco J. ||date=2010-05-11 |title=In the light of evolution IV: The human condition |url=http://faculty.sites.uci.edu/johncavise/files/2011/03/311-intro-to-ILE-IV.pdf |format=PDF |journal=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |location=Washington, D.C. |publisher=National Academy of Sciences |volume=107 |issue=Suppl. 2 |pages=8897–8901 |doi=10.1073/pnas.100321410 |issn=0027-8424 |accessdate=2014-12-29 |||}}</ref>。

[[File:ADN static.png|缩略图|右|200px|DNA結構，[[含氮鹼基|鹼基]]位於中心，外側環繞著由磷酸根與糖類所形成的[[雙螺旋]]。]]

{{see also|遺傳學|遺傳}}

最近的研究結果證實，遺傳變化的重要例子不能被DNA的核苷酸序列改變來解釋。此類現象被分類為[[表觀遺傳學|表觀遺傳]]系統<ref name="Jablonka09">{{cite journal |last1=Jablonka |first1=Eva |last2=Raz |first2=Gal |date=June 2009 |title=Transgenerational Epigenetic Inheritance: Prevalence, Mechanisms, and Implications for the Study of Heredity and Evolution |journal=The Quarterly Review of Biology |location=Chicago, IL |publisher=University of Chicago Press |volume=84 |issue=2 |pages=131–176 |doi=10.1086/598822 |issn=0033-5770 |pmid=19606595}}</ref>。[[DNA甲基化]]産生染色質，自我持續的代謝循環，通過RNA干擾導致基因表達沉默，蛋白質的三維構象(如[[朊毒體]])的一些區域在部分个体中曾發現表觀遺傳系統<ref name="Bossdorf10">{{cite journal |last1=Bossdorf |first1=Oliver |last2=Arcuri |first2=Davide |last3=Richards |first3=Christina L. |last4=Pigliucci |first4=Massimo ||date=May 2010 |title=Experimental alteration of DNA methylation affects the phenotypic plasticity of ecologically relevant traits in ''Arabidopsis thaliana'' |journal=Evolutionary Ecology |location=Dordrecht, the Netherlands |publisher=[[Springer Science+Business Media|Springer Netherlands]] |volume=24 |issue=3 |pages=541–553 |doi=10.1007/s10682-010-9372-7 |issn=0269-7653}}</ref><ref>{{harvnb|Jablonka|Lamb|2005}}{{page needed|date=December 2014}}</ref>。

水平基因轉移也可以經由[[抗原轉移]]（{{Lang|en|antigenic shift}}）、[[基因重整]]（{{Lang|en|reassortment}}）與[[雜交種|雜交]]反應（{{Lang|en|hybridisation}}）等現象觀察。[[病毒]]能夠透過[[轉導作用]]（{{Lang|en|transduction}}）在物種間傳遞基因<ref>[http://66.102.7.104/search?q=cache:tpICVNWaTbgJ:non.fiction.org/lj/community/ref_courses/3484/enmicro.pdf+sex+evolution+%22Horizontal+gene+transfer%22+-human+Conjugation+RNA+DNA&hl=en enmicro.pdf]{{dead link|date=November 2013}}</ref>。細菌則能夠與死亡的細菌合體、經由[[轉形作用]]（{{Lang|en|transformation}}），以及與活[[细菌|細菌]]進行[[接合]]（{{Lang|en|conjugation}}），而獲得新的基因。而新的基因則能夠以[[质粒|質體]]的形式，加入宿主細菌的基因組中<ref>[http://www2.nau.edu/~bah/BIO471/Reader/Pennisi_2003.pdf Pennisi_2003.pdf]</ref>。[[雜交種|雜交]]的現象在植物中最顯著<ref>Rieseberg LH, ''et al.'' ''Major ecological transitions in wild sunflowers facilitated by hybridization.'' 2003 Aug;29;301(5637):1211-6. PMID 12907807</ref>，此外目前已知還有10種以上的[[鸟|鳥類]]物種能夠[[雜交種|雜交]]<ref>Grant PR & Grant BR. ''Hybridization in bird species.'' Science. 1992 256;193-7</ref>。另外在[[哺乳动物|哺乳動物]]與[[昆虫|昆蟲]]中，也有[[雜交種|雜交]]的例子<ref>Gompert Z, ''et al.'' ''Homoploid hybrid speciation in an extreme habitat.'' Science. 2006 Dec;22;314(5807):1923-5. PMID 17138866</ref>，只是通常[[雜交種|雜交]]後代不具有生殖能力。{{Lang|en|HGT}}也是[[细菌|細菌]]傳遞[[抗藥性]]的方式之一<ref>Dzidic S & Bedekovic V. ''Horizontal gene transfer-emerging multidrug resistance in hospital bacteria'' Acta pharmacologica Sinica. 2003 Jun;24(6):519-26. PMID 12791177</ref>，而且有些發現表明{{Lang|en|HGT}}是[[原核生物]]與[[真核生物]]的'''演化'''重要機制<ref>Andersson JO. ''Lateral gene transfer in eukaryotes.'' Cellular and molecular life sciences. 2005 62:1182-97.</ref><ref>Katz LA, ''Lateral gene transfers and the evolution of eukaryotes: theories and data.'' International journal of systematic and evolutionary microbiology. 2002 52:1893-900.</ref>。

[[File:Peacock.displaying.better.800pix.jpg|缩略图|右|300px|[[孔雀]]顯眼又花枝招展的尾羽，是性擇的代表性例證，一方面使牠容易成為被獵食的目標，另一方面又能夠吸引雌性。]]

{{Main|自然選擇}}

族群中等位基因的自由移動，也受到族群結構的阻礙，例如族群的大小或是地理分布。雖然理想狀態中族群的生殖對象完全自由且完全隨機，但是現實世界中並非如此，因此地理上的親近程度會對這些基因的移動造成龐大的影響。而且當遷移數量較少的時候，基因流對演化的影響也較低<ref>曲若竹等。群體遺傳結構中的基因流。《遺傳》（中國）。2004。第26卷3期，377-382。</ref>。

{{Main|遺傳漂變}}

{{Main|物種形成}}

[[File:Zh-Speciation modes.png|缩略图|300px|四種物種形成過程的比較圖]]

{{Main|生物滅絕}}

[[File:ExtinctDodoBird.jpeg|缩略图|左|130px|最知名的已滅絕動物之一，[[渡渡鳥]]]]

地球上曾經有過多次大規模的[[绝灭|滅絕]]，其原因大多是因為環境，尤其是氣候的大幅改變。其中最嚴重的5次<ref name="BD">Gaston KJ & Spicer IJ. ''Biodiversity.'' 2nd edition. Blackwell Pulishing. 2004;39. ISBN 978-1-4051-1857-6</ref>，分別是[[奧陶紀]]後期（4億4千萬年前）、[[泥盆紀]]後期（3億6千萬年前）、[[二疊紀]]後期（2億5千萬年前）、[[三叠纪|三疊紀]]後期（2億0千萬年前）與[[白垩纪|白堊紀]]末期（6千6百萬年前）。其中[[二疊紀]]後期的[[二疊紀滅絕事件]]，大約95%的海洋生物與70%的陸地動物消失。[[白垩纪|白堊紀]]末期的[[白垩纪-第三纪灭绝事件|白堊紀滅絕事件]]，則因為[[恐龙|恐龍]]的滅絕而著名。

生物的多樣性和一致性是可以用演化論解釋，而智慧創造或直接神創則難以解釋這些現象。生物之間的[[同源特徵]]是演化的證據。因為所有的生物都有共同祖先，所以即使是外觀差異非常大的生物，仍然可以在[[分子生物學]]、[[比較胚胎學]]和[[比較解剖學]]上找到相似性。演化也可以解釋為什麼地球上會有這麼多種生物：適應不同[[棲位]]。在[[生物地理學]]上，相近區域的生物往往在[[分類學]]上非常相近，顯示出單一物種的[[輻射演化]]，而不同地點的生物也可能在類似的環境帶有類似的構造，顯示出[[趨同演化]]。源於[[最近共同祖先 (生物)|最近的共同祖先]]的[[同源|共同]]性狀在物種之間更相似，包括共同的[[DNA測序|DNA序列]]，可以作為進化關係的依據，建立[[系統發生樹|生命之樹]]（[[系统发生学]]）。<ref>{{Citation | last = Dobzhansky | first = Theodosius | | title = Nothing in Biology Makes Sense Except in the Light of Evolution | journal = American Biology Teacher | volume = 35 | issue = 3 | pages = 125-129 |date=March 1973 | jstor = 4444260}}; reprinted in {{Citation | editor-last = Zetterberg | editor-first = J. Peter | title = Evolution versus Creationism | year = 1983 | pages = | place = Phoenix, AZ | publisher = ORYX Press }}</ref>

{{Main|生命演化歷程|地球歷史|演化樹}}

[[File:Stromatolites.jpg|缩略图|300px|位在美国[[冰川國家公園 (美國)|冰川國家公園]]的[[前寒武紀]][[疊層石]]（{{Lang|en|stromatolite}}），可能是已知最早的生命[[化石]]紀錄。]]

在演化過程中，有許多關鍵性的生物分化，配合[[地質年代]]與演化歷程，能夠歸納出演化時間表。2015年一項在[[西澳]]的古老岩石進行的研究中發現41億年前「{{le|生物曾經存在| Biotic material }}的行跡」<ref name="AP-20151019">{{cite news |last=Borenstein |first=Seth |title=Hints of life on what was thought to be desolate early Earth |url=http://apnews.excite.com/article/20151019/us-sci--earliest_life-a400435d0d.html |date=2015-10-19 |work=[[Excite]] |location=Yonkers, NY |publisher=[[Mindspark Interactive Network]] |agency=[[Associated Press]] |accessdate=2015-10-20 |||}}</ref><ref name="PNAS-20151014-pdf">{{cite journal |last1=Bell |first1=Elizabeth A. |last2=Boehnike |first2=Patrick |last3=Harrison |first3=T. Mark |last4=Mao |first4=Wendy L. |display-authors=3 |date=2015-11-24 |title=Potentially biogenic carbon preserved in a 4.1 billion-year-old zircon |url=http://www.pnas.org/content/early/2015/10/14/1517557112.full.pdf |format=PDF |journal=[[Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.]] |location=Washington, D.C. |publisher=[[National Academy of Sciences]] |volume=112 |issue=47 |pages=14518–14521 |doi=10.1073/pnas.1517557112 |issn=0027-8424 |accessdate=2015-12-30 |pmid=26483481 |pmc=4664351 |||}}</ref>。[[原核生物|原核]]單細胞生物則出現在33億年前。到了18.5億年前，才出現最早的[[真核生物|真核]]單細胞生物。16億年前真核[[藻類]]出現。6.65億年前[[動物]]出現。再此之前的年代稱為[[前寒武紀]]<ref name="cb">Campbell NA & Reece JB. ''BIOLOGY'' 6th edition. Benjamin Cummimgs. 2002;487. ISBN 978-0-8053-6624-2</ref>。

[[中生代]]開始於2億5千百萬年前，這時[[羊膜动物]]的另一支[[蜥形纲]]以及[[裸子植物]]逐漸支配地球。1億4千5百萬年前到6千6百萬年前，[[開花植物]]出現，最後[[中生代]]結束於[[白垩纪-第三纪灭绝事件|白堊紀滅絕事件]]。

{{Main|演化生物學}}

演化生物學者有時會依據時間長短與差異程度，區分「[[微觀演化]]」（微演化）與「[[宏觀演化|宏-{}-觀演化]]」（廣演化）。[[微演化|微觀演化]]指几個世代中，基因频率小范围的变化，例如現今世界各地人類的差異。[[宏觀演化|宏-{}-觀演化]]指長時間的演化過程，例如人類與滅絕祖先或各種現存靈長類間的親緣關係。不過這只是為了研究方便所做的人為區分，並非生物演化在本質上存在的差異，像[[物種形成]]該放在哪一邊就沒有固定的分法。

[[File:Fitness-landscape-cartoon.png|250px|缩略图|生殖成就空間一般會顯現出山峰與山谷，山峰顯示生物所能達到的最高生殖成就，山谷則顯示其區隔，解釋特徵差異的存在。生殖成就空間除了可以如此圖般以二維方式呈現，也可以三維方式表達。圖中直向為生殖成就，橫向為[[表型|表現型]]變數。]]

[[File:Darwin ape.jpg|150px|缩略图|左|諷刺漫畫反映了早期人們對於「人類與猿類具有共同祖先」這個觀念的抵触。]]

有些人以為演化論在學界無共識、創造論和演化論一樣有效。如[[美國總統|前總統]][[罗纳德·里根|-{zh-hans:里根;zh-hk:列根;zh-tw:雷根;}-]]曾在1980年的一場[[選舉|競選]]活動中表示：“演化是一個理論，只是一個科學理論，直到現在依然在科學界中受到挑戰，並且尚未被科學界認為絕對正確。”這類說法強調演化只是一個理論，所以並不是真實存在的事物。然而對科學家而言，理論並非與事實對立。事實是指經驗上所得的資料或數據，理論則是對事實的解釋與想法。里根更說，如果學校要教進化論，也要教聖經上對人類來源的解釋，「而近年來的發現，指出了進化論重大的破綻」<ref>{{Cite news| last = Douglas Dowie| title = Reagan favoring 'old time religion'| work = The Telegraph| accessdate = 2012-10-05| date = 1980-08-23| url = http://news.google.com/newspapers?id=rqArAAAAIBAJ&sjid=YvwFAAAAIBAJ&pg=5913,4639868&dq=reagan+evolution&hl=en}}</ref>。這正與事實相反。2005年美国[[總統]][[乔治·W·布什|布希]]公開贊成學校同時教授[[智慧設計論]]與[[演化論]]。批評者說：「喬治·布什可以證明，受過哈佛和耶魯教育，也影響不了一個人的頑固。」<ref>粟德金。[http://www.washingtonobserver.org/article.cfm?articleid=1112&charid=2 美國政教分離，分而不離] 。《華盛頓觀察》週刊。2005年10月。第36期。</ref>。

物種形成有時候被認為是無法直接觀察的現象，並得出演化是不科學的結論。但是科學的發現不僅是經由可重複的實驗，均變說（''{{Lang|en|uniformitarianism}}''）使科學家得以用經驗來推論事物的原因<ref>野外地質觀察 - [http://www.nhlue.edu.tw/~earth/LW.pdf 野外地質調查的理論與實務]{{dead link|date=November 2013}}</ref>。此外物種形成的例子也出現在植物<ref>{{Lang|en|Kramer EM & Donohue K. ''Evolution. Traversing the adaptive landscape in snapdragons.''，Science}}，2006年8月18日，313(5789):924-5. PMID 16917048</ref>。還有刺魚（''{{Lang|en|stickleback}}''）的[[外胚葉發育不全]]（''{{Lang|en|ectodysplasin}}''）等位基因，被用來當作研究基因轉變與物種形成的模型<ref>{{Lang|en|Gibson G. ''Evolution. The synthesis and evolution of a supermodel.''，Science}}，2005年3月25日，307(5717):1890-1. PMID 15790836</ref>。有一種類似的觀點，認為微觀演化是可以觀察，而宏觀演化則無法觀察。但是由於宏觀演化的機制與微觀演化相同，所以宏觀演化事實上已經在微觀演化中被觀察<ref>{{Lang|en|Douglas Theobald. - [http://www.talkorigins.org/faqs/comdesc/ 29+ Evidences for Macroevolution.] TalkOrigins.}}</ref>。而且物種之間基因序列的比較，也顯示少量的遺傳變異，就可以導致外表相當大的變化。

* [[考古學]]

* [[進化演算法]]

{{进化}}