01. 内务部 部长：钱瑛 → 曾山
02. 外交部 部长：陈毅（兼）
03. 国防部 部长：彭德怀（兼） → 林彪（兼）
04. 公安部 部长：罗瑞卿（兼） → 谢富治
05. 国家基本建设委员会 主任：陈云（兼）
06. 国家计划委员会 主任：李富春（兼）
07. 国家经济委员会 主任：薄一波（兼）
08. 国家科学技术委员会 主任：聂荣臻（兼）
09. 财政部 部长：李先念
10. 粮食部 部长：沙千里
11. 商业部 部长：程子华 → 姚依林
12. 对外贸易部 部长：叶季壮
13. 水产部 部长：许德珩
14. 冶金工业部 部长：王鹤寿
15. 化学工业部 部长：彭涛
16. 第一机械工业部 部长：赵尔陆 → 段君毅
17. 第二机械工业部 部长：宋任穷 → 刘杰
18. 煤炭工业部 部长：张霖之
19. 石油工业部 部长：余秋里
20. 地质部 部长：李四光 | 21. 建筑工程部 部长：刘秀峰
22. 纺织工业部 部长：蒋光鼐
23. 轻工业部 部长：李烛尘
24. 铁道部 部长：滕代远
25. 交通部 部长：王首道
26. 邮电部 部长：朱学范
27. 农业部 部长：廖鲁言（1964年9月起江一真代理）
28. 农垦部 部长：王震
29. 林业部 部长：刘文辉
30. 水利电力部 部长：傅作义
31. 劳动部 部长：马文瑞
32. 文化部 部长：沈雁冰
33. 教育部 部长：杨秀峰
34. 卫生部 部长：李德全
35. 体育运动委员会 主任：贺龙（兼）
36. 民族事务委员会 主任：乌兰夫（兼）
37. 对外文化联络委员会 主任：张奚若
38. 华侨事务委员会 主任：廖承志
39. 农业机械部 部长：陈正人
40. 第三机械工业部 部长：张连奎 → 孙志远 |
